Spezielle Tools sind zwar in Planung, aber wohl eher mittelfristig zu erwarten.
Inwieweit ist der Zugang zu den Dateien denn erschwert? Vieles ist ja im XML Format und damit vollkommen (human-)lesbar. Asserts allerdings sind durch Unity3D nicht so einfach als modifizierbar zu handhaben, und das wird wohl auch noch so bleiben.